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ELISA、免疫 PCR 與 SIMOA:蛋白質(zhì)檢測(cè)工具的比較

更新時(shí)間:2023-08-03      點(diǎn)擊次數(shù):1692

介紹

ELISA(酶聯(lián)免疫吸附測(cè)定)是蛋白質(zhì)檢測(cè)的“金標(biāo)準(zhǔn)"方法。1在本博客中,回顧了三種流行的 ELISA 平臺(tái):標(biāo)準(zhǔn) ELISA、免疫 PCR單分子陣列 (SIMOA)。我們將對(duì)這些 ELISA 的設(shè)計(jì)原理、樣本量、儀器和靈敏度進(jìn)行比較。

ELISA 的工作原理

ELISA的基本設(shè)計(jì)原理取決于抗體-抗原相互作用的穩(wěn)定性和特異性。簡(jiǎn)而言之,固定在珠子或微孔板等固體基質(zhì)上的捕獲抗體可與多種樣品類(lèi)型中的目標(biāo)蛋白結(jié)合。此類(lèi)樣品可包括血漿、血清、細(xì)胞和組織裂解物、條件培養(yǎng)基或尿液。

1971 年引入 ELISA 時(shí),酶標(biāo)記抗原被纖維素顆粒上的抗體捕獲。2然后通過(guò)反復(fù)離心和洗滌分離抗體-抗原綴合物。此后,不同的 ELISA 格式被開(kāi)發(fā)出來(lái),包括夾心 ELISA,其中目標(biāo)蛋白“夾在"捕獲抗體和標(biāo)記檢測(cè)抗體之間(圖 1)。這種 ELISA 格式具有高度特異性,因?yàn)?/span>需要兩種抗體與蛋白質(zhì)結(jié)合才能進(jìn)行檢測(cè)。此外,可以用標(biāo)準(zhǔn)曲線確定蛋白質(zhì)濃度(即定量數(shù)據(jù))。image.png

圖 1. 夾心 ELISA 使用兩種抗體來(lái)靶向蛋白質(zhì),從而具有高特異性。


這里討論的 ELISA 平臺(tái)——標(biāo)準(zhǔn) ELISA、免疫 PCR單分子陣列 (SIMOA) ——是生成定量數(shù)據(jù)的夾心 ELISA。然而,它們?cè)诘孜?、檢測(cè)方法、儀器、樣品體積和靈敏度方面有所不同。


標(biāo)準(zhǔn)酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)

標(biāo)準(zhǔn) ELISA (sELISA) 將捕獲抗體固定到透明塑料 96 孔微孔板上(圖 2、表 1)。該檢測(cè)抗體與辣根過(guò)氧化物酶 (HRP) 結(jié)合,該酶可將其底物 3,3',5,5'-四甲基聯(lián)苯胺 (TMB) 還原為藍(lán)色和氧化形式。顏色的變化與 HRP 的量成正比,并且推論與樣品中目標(biāo)蛋白的量成正比。添加硫酸可終止 HRP-TMB 反應(yīng),導(dǎo)致顏色從藍(lán)色變?yōu)辄S色。使用酶標(biāo)儀在 450 nm 處測(cè)量吸光度。


圖 2. 標(biāo)準(zhǔn) ELISA 的工作原理。標(biāo)準(zhǔn) ELISA 使用 HRP 偶聯(lián)的檢測(cè)抗體和比色底物來(lái)檢測(cè)捕獲的蛋白質(zhì)。

標(biāo)準(zhǔn)免疫PCRSIMOA
基質(zhì)96孔微孔板96孔PCR板珠子
檢測(cè)方法比色法聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)熒光
樂(lè)器讀板器實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀專(zhuān)用儀器
樣品量*100微升10-25 µL125微升
靈敏度高的更高最高

表 1. 標(biāo)準(zhǔn) ELISA、免疫 PCR 和單分子陣列 (SIMOA) 的比較。 * = 樣品稀釋后每次重復(fù)的最終體積。

sELISA 的靈敏度一般范圍為 1 pg/ml 至 100 pg/ml。然而,一些 sELISA 的定量限 (LLOQ) 低至亞 pg/ml 或高達(dá) 10 ng/ml。與所有 ELISA 一樣,靈敏度取決于所用抗體的靈敏度。

對(duì)于標(biāo)準(zhǔn) 96 孔板,最終樣品體積為每孔 100 µL。使用“半面積"板可以減少體積 (50 µL) ,其中孔的直徑為一半寬,但測(cè)定靈敏度也可能會(huì)降低。用于任何ELISA 的原始樣品體積將取決于最佳樣品稀釋度,該稀釋度會(huì)因蛋白質(zhì)、樣品類(lèi)型和實(shí)驗(yàn)而異。

將樣品添加到板中后,大約 5 小時(shí)內(nèi)即可獲得結(jié)果。然而,當(dāng)樣品和抗體同時(shí)添加到板中時(shí),可以實(shí)現(xiàn)更快的周轉(zhuǎn)時(shí)間。這減少了孵育步驟和洗滌步驟的數(shù)量。例如,SpeedELISA的處理時(shí)間為 3 小時(shí),在添加樣品之前同時(shí)孵育板上的捕獲檢測(cè)抗體。其他方法包括一步添加樣品和兩種抗體,或者將樣品和檢測(cè)抗體一起添加。然而,減少處理時(shí)間會(huì)降低靈敏度(圖 3)。

圖 3. 多步 sELISA 和SpeedE LISA 在靈敏度和檢測(cè)范圍方面的比較。針對(duì)人 (A) CD26 和 (B) 可溶性 IL-6 受體 (IL-6 sR) 的標(biāo)準(zhǔn)曲線數(shù)據(jù)。兩種測(cè)定均使用相同的標(biāo)準(zhǔn)品和抗體對(duì)。使用 RayBiotech Life, Inc.(Peachtree Corners,GA;美國(guó))的 sELISA 和 SpeedELISA 試劑盒對(duì)人 CD26 和 IL-6 sR 進(jìn)行分析(CD26:sELISA 試劑盒貨號(hào) ELH-CD26,SpeedELISA 試劑盒貨號(hào) ELHS-CD26)( IL-6 sR:sELISA 試劑盒目錄號(hào) ELH-IL6sR,SpeedELISA 試劑盒目錄號(hào) ELHS-IL6sR)。 OD = 光密度。

sELISA 的主要優(yōu)點(diǎn)是提供低成本試劑盒,可以針對(duì)來(lái)自多個(gè)物種的數(shù)千種不同蛋白質(zhì)。此外,sELISA 幾乎不需要培訓(xùn),可生成易于解釋的數(shù)據(jù),并使用與其他檢測(cè)兼容的經(jīng)濟(jì)實(shí)惠的酶標(biāo)儀。這些優(yōu)點(diǎn)導(dǎo)致 sELISA 在研究中得到廣泛使用。

免疫PCR (IQELISA TM )

免疫 PCR也稱(chēng)為免疫定量 ELISA (IQELISA),將捕獲抗體粘附到塑料 96 孔 PCR 板上,同時(shí)檢測(cè)抗體與 DNA 條形碼綴合(圖 4、表 1)。使用 PCR,雙鏈 (ds) DNA 條形碼在條形碼特異性引物和與 dsDNA 結(jié)合的熒光染料存在的情況下分別被擴(kuò)增和染色。熒光與 dsDNA 的量成正比,因此也與樣品中目標(biāo)蛋白的量成正比。使用實(shí)時(shí) PCR 儀器測(cè)量熒光。

圖 4. 免疫 PCR 的工作原理。免疫 PCR 使用 DNA 條形碼檢測(cè)抗體和 dsDNA 熒光染料來(lái)檢測(cè)捕獲的蛋白質(zhì)。

IQELISA 的一個(gè)優(yōu)點(diǎn)是其體積要求小,每次重復(fù)的最終體積僅為 10 µL。因此,當(dāng)樣品量有限或難以獲得樣品時(shí),IQELISA 是一個(gè)特別有吸引力的選擇。然而,IQELISA 比 sELISA 在技術(shù)上更具挑戰(zhàn)性,因?yàn)樗枰_的移液。此外,樣品應(yīng)至少重復(fù)三次,因?yàn)樾◇w積會(huì)增加異常值的機(jī)會(huì)。

DNA 通過(guò) PCR 擴(kuò)增循環(huán)呈指數(shù)增長(zhǎng)。因此,與使用相同抗原和抗體對(duì)的 sELISA 相比,IQELISA 的 LLOQ 平均增加了 23 倍。靈敏度的增加取決于抗體,范圍從無(wú)變化到 105 倍(圖 5)。

從樣品孵育到數(shù)據(jù)收集,IQELISA 大約需要 5.5 小時(shí)。該周轉(zhuǎn)時(shí)間與 sELISA 類(lèi)似。

圖 5. sELISA 和免疫 PCR 對(duì) 28 種蛋白質(zhì)的敏感性比較。 sELISA 和免疫 PCR ELISA 均使用每個(gè)靶標(biāo)的相同標(biāo)準(zhǔn)品和抗體對(duì)。該圖和圖 8 使用相同的 RayBiotech Life, Inc. 的 sELISA 試劑盒和 IQELISA 試劑盒。

單分子陣列 (SIMOA TM )

SIMOA是一種超靈敏 ELISA,使用抗體包被的珠子和熒光偶聯(lián)的檢測(cè)抗體(圖 6、表 1)。將珠子、樣品和檢測(cè)抗體混合在一起后,將溶液施加到具有超過(guò) 235,000 個(gè)微孔的卡盒中。每個(gè)微孔只能容納一顆珠子。然后將油添加到卡盒中,將樣品推過(guò)微孔陣列的表面并形成孔的液密密封。

使用配備熒光顯微鏡的全自動(dòng)或半自動(dòng)系統(tǒng)測(cè)量熒光;該儀器由 SIMOA( Quanterix ;Billerica,MA;美國(guó))開(kāi)發(fā)商制造。由于每個(gè)孔只能包含一個(gè)珠子,因此具有熒光的微孔的數(shù)量與樣品中目標(biāo)蛋白的量成正比。這使得單分子檢測(cè)成為可能。

圖 6. 單分子陣列的工作原理。 SIMOA 使用熒光偶聯(lián)檢測(cè)抗體和微孔來(lái)檢測(cè)捕獲的蛋白質(zhì)。

SIMOA 的一個(gè)關(guān)鍵優(yōu)勢(shì)是它可以檢測(cè)飛摩爾范圍內(nèi)的蛋白質(zhì)。也就是說(shuō),靈敏度通常在 10 fg/ml 至 1 pg/ml 范圍內(nèi)。與 sELISA 和 IQELISA 相比,SIMOA 的平均靈敏度分別提高了 465 倍和 63 倍。

將試劑裝入 Quanterix 儀器后,大約需要 3 小時(shí)才能獲取數(shù)據(jù)。因此,SIMOA 的程序時(shí)間比 sELISA 和 IQELISA 都短。

雖然 SIMOA 實(shí)現(xiàn)了此處評(píng)測(cè)的三個(gè)平臺(tái)中的一些最高靈敏度,但該技術(shù)也有一些缺點(diǎn)。首先,目前使用該技術(shù)分析的蛋白質(zhì)數(shù)量很少(~165)。其次,SIMOA 試劑盒的成本高于 sELISA 和 IQELISA 試劑盒。第三,檢測(cè)儀器價(jià)格昂貴,且只能用于SIMOA,是專(zhuān)用儀器,需要專(zhuān)門(mén)培訓(xùn)才能運(yùn)行。

圖 7. sELISA 和 SIMOA 在靈敏度和檢測(cè)范圍方面的比較。通過(guò)將純化的人(A) IL-6 或(B) TNA α 添加到緩沖液中生成標(biāo)準(zhǔn)曲線數(shù)據(jù)。 RayBiotech Life, Inc. 的每個(gè)靶標(biāo)的相同標(biāo)準(zhǔn)品和抗體對(duì)用于 sELISA 和 SIMOA(IL-6,sELISA 目錄號(hào) ELH-IL6;TNF α,sELISA 目錄號(hào) ELH-TNF)。 Y 軸 = 標(biāo)準(zhǔn)化信號(hào),其中減去空白信號(hào)。信號(hào) = sELISA 450 nm 處的 OD 或 SIMOA 的每珠平均酶 (AEB)??瞻?不含目標(biāo)蛋白的緩沖液。

多重ELISA

值得一提的是,IQELISA 和 SIMOA 分別可以同時(shí)分析多達(dá) 3 個(gè)和 6 個(gè)目標(biāo)。除了需要更少的樣品之外,在分析相同數(shù)量的蛋白質(zhì)時(shí),多重檢測(cè)通常比單重檢測(cè)更具成本效益。重要的是,多重檢測(cè)會(huì)降低 IQELISA 的靈敏度,而使用SR-X TM生物標(biāo)志物檢測(cè)系統(tǒng)的SIMOA 則不會(huì)影響靈敏度。

還提供其他定量多重 ELISA 選項(xiàng),包括 Quantibody® 和 RayPlex TM 抗體陣列。Quantibody可以使用 100 µL 稀釋樣品在 6 小時(shí)內(nèi)分析多達(dá) 40 種蛋白質(zhì),一式四份。使用兼容的激光掃描儀采集數(shù)據(jù)。RayPlex可以使用流式細(xì)胞術(shù)在 4 小時(shí)內(nèi)每次重復(fù)使用 25 µL 稀釋樣品測(cè)量多達(dá) 25 種蛋白質(zhì)。兩種抗體陣列的靈敏度與 sELISA 相似。

在我們的博客“使用抗體陣列進(jìn)行多重蛋白質(zhì)檢測(cè)"或我們的視頻“為您的研究識(shí)別正確的抗體陣列"中了解如何確定用于多重蛋白質(zhì)檢測(cè)的正確抗體陣列。

概括

標(biāo)準(zhǔn) ELISA、免疫 PCR (IQELISA) 和 SIMOA 相互比較時(shí)具有優(yōu)點(diǎn)和缺點(diǎn):

  • sELISA是一種簡(jiǎn)單的比色測(cè)定法,數(shù)據(jù)易于解釋?zhuān)虼藥缀醪恍枰嘤?xùn)。使用能夠測(cè)量 450 nm 吸光度的酶標(biāo)儀在 5 小時(shí)內(nèi)獲得數(shù)據(jù)。使用比 IQELISA 和 SIMOA 試劑盒便宜的試劑盒可以靶向數(shù)千種不同的蛋白質(zhì)。然而,與 IQELISA 和 SIMOA 相比,sELISA 的靈敏度低。

  • 免疫PCR使用實(shí)時(shí)PCR儀器,在6小時(shí)內(nèi)收集數(shù)據(jù)。在此介紹的三個(gè) ELISA 平臺(tái)中,它的體積要求低,但比 sELISA 需要更多的移液和數(shù)據(jù)分析技術(shù)專(zhuān)業(yè)知識(shí)。平均而言,其靈敏度比 sELISA 高 23 倍??梢酝瑫r(shí)檢測(cè) 3 種蛋白質(zhì),但檢測(cè)靈敏度會(huì)降低。

  • SIMOA的靈敏度最高,其靈敏度平均分別比 sELISA 和 IQELISA 提高了 465 倍和 63 倍。使用需要專(zhuān)門(mén)培訓(xùn)的昂貴專(zhuān)用儀器可在 3 小時(shí)內(nèi)獲得數(shù)據(jù)。它還需要比 sELISA 和 IQELISA 更多的樣本量。一次可以分析多達(dá) 6 種蛋白質(zhì),而不會(huì)影響靈敏度。

圖 8 表明,對(duì)于許多蛋白質(zhì),LLOQ 的總體改進(jìn)遵循以下趨勢(shì):SIMOA > IQELISA > sELISA。不過(guò),也有例外。例如,IQELISA 對(duì)人 IL-1β 的靈敏度最高,為 0.0064 pg/ml,而 sELISA 和 SIMOA 的 LLOQ 分別為 0.3 和 0.04 pg/ml。

圖 8. sELISA、免疫 PCR 和 SIMOA 之間靈敏度倍數(shù)增加的比較。 RayBiotech Life, Inc. 的每個(gè)靶標(biāo)的相同標(biāo)準(zhǔn)品和抗體對(duì)用于所有平臺(tái)。目標(biāo)包括 28 種人類(lèi)蛋白質(zhì)、3 種小鼠蛋白質(zhì)和 1 種大鼠蛋白質(zhì)。(A) 17 種蛋白質(zhì)的靈敏度提高了 0 – 100 倍;不包括(B)或(C)中的蛋白質(zhì)。(B)九種蛋白質(zhì)的敏感性增加了 0 – 1,000 倍;不包括(A)或(C)中的蛋白質(zhì)。(C)兩種蛋白質(zhì)的敏感性增加了 0 – 10,000 倍;不包括(A)或(B)中的蛋白質(zhì)。 Y 軸 = 與 X 軸下方描述的第二 ELISA 平臺(tái)相比,第一個(gè) ELISA 平臺(tái)的靈敏度增加倍數(shù)。水平線=中位數(shù)。

結(jié)論

最常見(jiàn)的蛋白質(zhì)檢測(cè)工具之一是 ELISA。在這里,我們比較了三種流行的夾心 ELISA 平臺(tái):標(biāo)準(zhǔn) ELISA免疫 PCR單分子陣列 (SIMOA)。在為研究選擇合適的 ELISA 時(shí),其底物、檢測(cè)方法、儀器、樣品量、靈敏度和成本是重要的考慮因素。標(biāo)準(zhǔn) ELISA 是流行的方法,因?yàn)?/span> 可以使用低成本 試劑盒來(lái)靶向來(lái)自多個(gè)物種的數(shù)千種不同蛋白質(zhì)。此外,它幾乎不需要培訓(xùn)即可運(yùn)行,其數(shù)據(jù)易于解釋?zhuān)⑶沂褂梅菍?zhuān)用 酶標(biāo)儀 與其他測(cè)定兼容。一個(gè)關(guān)鍵要點(diǎn)是 ELISA 靈敏度和成本之間需要權(quán)衡:靈敏度越高,成本越高。成本考慮了套件、培訓(xùn)、勞動(dòng)力和所需儀器的價(jià)格。因此,sELISA 是實(shí)惠的選擇,而 SIMOA 是最敏感的。

對(duì)于不具備必要的專(zhuān)業(yè)知識(shí)或設(shè)備來(lái)使用此處討論的 ELISA 平臺(tái)分析樣品的實(shí)驗(yàn)室,RayBiotech Life, Inc. 提供完整的測(cè)試服務(wù)。該服務(wù)提供完整的報(bào)告,包括原始數(shù)據(jù)、標(biāo)準(zhǔn)曲線和定量數(shù)據(jù)。蛋白質(zhì)濃度。





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